برو :: apphandle برو :: apphandle attology ontology data api handler است.
انون بارر ن

برو :: apphandle رتبه بند و خلاصه

برو :: apphandle برسب ها

ماول رل API هست شناس ن هست شناس ن نترلر API

برو :: apphandle شرح

برو :: apphandle ااه اطلاعات هست شناس ن است. برو :: APPHADLE نوع هست شناس ن ontology api handler.synopsis استفاده از برو :: apphandle؛ $ dbname = "go"؛ # اتصال به ااه داده در مزبان خاص $ apph = برو :: apphandle-> connect (-dbname => $ dbname، -dbhost => $ mysqlhost)؛ # مثال 1 # جمع آور اصطلاح از DataSource $ term = $ apph-> get_term ({acc => "برو: 0003677"})؛ printf "go term؛ نام = s go id = sn"، $ term-> name ()، $ term-> public_acc ()؛ # مثال 2 # درافت لست از انجمن ها به ER # (و تمام شراط GO ه زرمجموعه ها ER ا # واقع در داخل ER) # است ه برا آن شواهد منطق مناسب وجود دارد (Assable Author / Direct Assay) $ Assocs = $ apph-> get_associations ({name => "endoplasmic رتولوم"} {evcodes => }؛ foreach $ Assoc (@ $ Assocss) {printf "ن: s شواهد برا انجمن: s s"، $ assoc-> gene_product-> symbol، $ assoc-> شواهد-> د ()، $ assoc-> شواهد- Xref-> Xref_Key ()؛ } # مثال 3 # برداشت زر go $ graph = $ apph-> get_graph (-Acc => 3677، -depth => 3)؛ foreach $ sermer من (@ $ graph-> get_all_nodes}) {printf "go term؛ نام = s go id = sn"، $ term-> نام ()، $ term-> public_acc ()؛ } # مثال 4 # درافت زرراف از برو، # و با استفاده از ترارر راف به # نماش نمودار $ graph = $ apph-> get_graph_by_search ("DNA Helicase *")؛ $ IT = $ graph-> create_iterator؛ در حال ه ($ ni = $ it-> next_node_instance) {$ depth = $ ni-> عمق؛ $ term = $ ni-> term؛ printf " s term = s ( s) // n_assocs = s // عمق = DN"، "----" x $ depth، $ term-> نام، $ term-> public_acc، $ term -> n_associations || 0، $ عمق؛ } # مثال 5 # به دست آوردن زرراف از GO، # محدود ردن توسط محصولات ن # درافت تمام شراط ه برا حاشه نوس ان دو ن SGD $ شراط شراط = $ apph-> get_terms ({products => }})؛ # ساخت راف تمام راه را به ره ها بر # از شراط فوق $ graph = $ apph-> get_graph_by_terms ($ شراط، -1)؛ # اجاد ترار ننده در نمودار $ it = $ graph-> create_iterator؛ # از طرق هر ره در راف در حال ه ($ ni = $ it-> next_node_instance) {$ depth = $ ni-> عمق؛ $ term = $ ni-> term؛ printf " s term = s ( s) // assocss = sn"، "----" x $ depth، $ term-> نام، $ term-> public_Acc، وستن ("؛"، نقشه { $ _--> gene_product-> acc} @ {$ term-> انجمن_ لست})؛ } الزامات: رل

برو :: apphandle نرم افزارها مرتبط