بوراف :: راف تولد تصاور GD از Bio :: SEQ اشاء
انون بارر ن

بوراف :: راف رتبه بند و خلاصه

بوراف :: راف برسب ها

ماول رل رل تصاور gd تصاور GD

بوراف :: راف شرح

تولد تصاور GD از بوراف :: اشاء SEQ BIO :: Graphics ماول Perl برا تولد تصاور GD از Bio:: SEQ Objects.Synopsis # ان اسرت تصور PNG از منطقه 10K را تولد م ند ه حاو مجموعه ا از و ها قرمز و مجموعه ا از و ها آب است. با آن تماس برد: # Red_and_blue.pl> RedBlue.png # شما هم انون م تواند تصور را با برنامه Image مورد علاقه خود مشاهده ند # ان اسرت فال GenBank ا EMBL را ه بر رو خط فرمان نامده م شود را تجزه م ند و تولد PNG را تولد م ند. آن را مانند ان تماس برد: # render.pl my_file.embl | صفحه نماش - استفاده از سخت استفاده از Bio :: Graphics؛ استفاده از BIO :: SEQIO؛ $ file = shift ا dieve "ارائه فال توال به عنوان استدلال"؛ $ IO = Bio :: Seqio-> New (-File => $ فال) ا DIE "نم تواند BIO: SEQIO اجاد ند"؛ $ seq = $ io-> next_seq ا die "نمتواند دنباله ا را در فال دا ند"؛ feTures = $ seq-> all_seqfeatures؛ # و ها مرتب ساز بر اساس برسب ها اصل خود را sorted_features؛ برا $ f (@features) من {$ tag = $ f-> primary_tag؛ فشار @ {$ sorted_features {$ tag}}، $ f؛ } my wholeseq = bio :: seqfeature :: generic-> new (-START => 1، -end => $ seq-> طول)؛ $ panel = bio :: graphics :: panel-> new (-Length => $ seq-> طول، -key_style => "بن '، -width => 800، -pad_left => 10، -pad_Right => 10 ،)؛ $ panel-> add_track ($ wholeseq، -glyph => 'arrow'، -bump => 0، -DOUBLE => 1، -Tick => 2)؛ $ panel-> add_track ($ wholeseq، -glyph => 'generic'، -bgcolor => 'blue'، -label => 1،)؛ # CASE عموم MYCOLORS = QW (CYAN ORANG BLUE بنفش سبز سبز Chartreuse Magenta Yellow Aqua)؛ $ idx = 0؛ برا $ $ برسب (لدها مرتب ساز sorted_features) {$ $ و ها = $ sorted_features {$ tag}؛ $ panel-> add_track ($ و ها، -glyph => 'generic'، -bgcolor => $ colors ، -fgcolor => 'black'، -Font2Color => 'RED'، -Key = > "$ {tag} s"، -bump => +1، -height => 8، -label => 1، -description => 1،)؛ } print $ panel-> png؛ خروج 0؛ الزامات: رل

بوراف :: راف نرم افزارها مرتبط