bissnp

ابزار برا نوت در بسولفت، توال مواز مواز به طور سترده ا بر رو لت فرم Illumina درمان شده است
انون بارر ن

bissnp رتبه بند و خلاصه

تبلغات

  • Rating:
  • مجوز:
  • Freeware
  • نام ناشر:
  • USC Epigenome Center
  • وب سات ناشر:
  • سستم ها عامل:
  • Mac OS X
  • حجم فال:
  • 8.6 MB

bissnp برسب ها


bissnp شرح

BISSNP ابزار مبتن بر تجزه و تحلل نوم تجزه و تحلل Genome (GATK) اروب اهش افته برا نوت در توال مواز با بسولفت (Bisulfite-SEQ، RRBS و NOME-SEQ) بر رو لت فرم Illumina است. BISSNP با استفاده از نتجه ر بز با امانات متلاسون مشخص شده ا به صورت دست از زمنه ها مختلف ستوزن (نه تنها CPG، ChH، CHG در بسولفت-SEQ، بله GCH et.al. در سار توال ها درمان شده با بسولفت) برا تعن نوت ها و سطوح متلاسون همزمان. علاوه بر ان، BISSNP برا هر دو طرف ت اان و زوج ار م ند. وه و حساست توسط آراه Illumina IM SNP تاد شده است. به طور ش فرض آستانه (نمره PHRED مقاس> 20)، م تواند 92.21 SNPs heterozygous را با 0.14 نرخ مثبت اذب (حساست 90.88 در SNPs C / T با 0.16 مزان مثبت اذب، 98.51 حساست در SNPs غر C / T را شناسا ند 0.16 نرخ مثبت اذب). تماس ستوزن م تواند زمنه ستوزن مرجع را تشخص دهد، زرا تنها بر اساس زمنه مرجع است.


bissnp نرم افزارها مرتبط

زن

به شما امان م دهد تا فراند تغر شل را مطالعه ند ...

137 839 KB

دانلود