jaligner الورتم اسمت-واترمن در جاوا برا هماهن توال جفت محل بولو اجرا شده است
انون بارر ن

jaligner رتبه بند و خلاصه

jaligner برسب ها

توال تراز ردن تراز ننده توال aligner ترتب دادن ترتب ترتب

jaligner شرح

الورتم اسمت-واترمن در جاوا برا هماهن توال جفت محل بولو اجرا شده است Jaligner منبع باز JAVA منبع باز از الورتم اسمت-واترمن با بهبود Gotoh برا هماهن توال جفت محل بولو با استفاده از مدل مجازات GAP است. در انجا برخ از و ها لد "Jaligner" وجود دارد: د فضا برا انجام برنامه نوس وا با ماترس نمرات اصل شباهت اصل و 2 ماترس شاف م از O (m؟ n) به O (n) اهش م ابد، جا ه m و n اندازه ها توال عمود و توال افق هستند به ترتب، با استفاده از آراه ها اف ت بعد از اندازه n به جا آراه ها دو بعد دو بعد اندازه m؟ n. آراه دو بعد از اندازه m ان رورد روند تخصص حافظه را افزاش م دهد، زرا دستاه مجاز جاوا (JVM) تلاش م ند تا آراه ت بعد از m؟ n "bytes" (نوع داده ها اوله) را تخصص دهد، به جا تلاش برا تخصص آراه ا از "اشاء" ، هر دام "آراه" n bytes است. علاوه بر ان شامل 70 ماترس به ثمر رساند، ه از سات NCBI برداشته شده است، Jaligner نز با ماترس ها به دست آمده توسط اربر تعرف شده است. آسان است برا استفاده از jaligner از طرق رابط اربر راف دوستانه (GUI)، نحو خط فرمان ساده و ا رابط اربر برنامه نوس قابل استفاده مجدد (API) استفاده ند.

jaligner نرم افزارها مرتبط